Ящик предложений Мэдаки: Сверхлюди

После победы над Мьюри Ундзэном студенческий совет во главе с Медаки Куроками восстановил порядок в Академии Хаконива. Однако период спокойствия оказывается кратковременным. Вскоре члены студенческого совета - Медаки Куроками, Дзэнкити Хитоёси, Коки Акунэ и Могане Кикаидзима - сталкиваются с новой угрозой, превосходящей предыдущие по сложности.

В академии вновь начинают происходить необычные события, когда становится известно о замыслах директора школы. Его секретный проект, получивший название «План Флакона», содержит элементы тирании и манипуляции, постепенно распространяющиеся на всё школьное пространство. Параллельно появляется группа новых студентов, именующая себя «Партия тринадцати».

Эта группа сверхспособных учащихся под руководством Удо Мияконодзе представляет серьёзную проблему для студенческого совета. Их действия направлены на захват власти и разрушение существующего порядка. Ситуация усложняется с возвращением ранее побеждённого противника, который намерен завершить начатое противостояние.