Союз Серокрылых

Действие происходит в городе Альтомар, который является столицей водного региона. Согласно местной легенде, в городе обитают два редких покемона - Ратиас и Ратиос. Главный персонаж Эш Кетчум со своим покемоном Пикачу прибывает в этот город, где случайно встречает этих легендарных покемонов. Ратиас и Ратиос обладают тесной эмоциональной связью и могут обмениваться чувствами без слов.

На покемонов начинают охотиться сёстры Занна и Рион, профессиональные охотники за покемонами. В процессе погони они вовлекают в конфликт Эша и его спутников. Ситуация осложняется тем, что Ратиас и Ратиос обладают способностью под названием "Капля души", которая потенциально может привести к затоплению города Альтомар.

Сюжет развивается вокруг попыток Эша защитить легендарных покемонов от охотников, одновременно предотвращая возможное разрушение города. Дополнительной интригой становится появление покемона Деоксис, который атакует город. Разгадка этих событий раскрывается по мере развития сюжета аниме.