Медуза не умеет плавать в ночи

Коеми Арараги является учеником старших классов японской школы. В прошлом он был вампиром, но смог преодолеть свои инстинкты и начал вести обычную жизнь. В настоящее время он готовится к выпускным экзаменам, скрывая свое прошлое от окружающих. Во время одного из школьных дней его действия случайно приводят к появлению энергетической воронки в учебном классе.

В результате инцидента в классе остаются только Коеми и его одноклассница, с которой у него были конфликты в прошлом. К ним присоединяется Оги Осино - ученица младших классов, являющаяся племянницей Мэмэ Осино, специалиста по сверхъестественным явлениям. Трое учащихся начинают совместное расследование причин возникновения аномалии.

В процессе расследования группа сталкивается с угрозой проникновения потусторонних существ в мир людей. Учащимся необходимо не только выяснить природу энергетической воронки, но и предотвратить возможные последствия ее существования, используя знания и опыт Мэмэ Осино в области паранормальных явлений.